仙俠情緣作為一款動作類角色扮演的游戲自然是少不了副本的存在，當然呢游戲的副本系統有一大部分是鑲嵌在主線劇情里面的。

而游戲又總共兩百章，每一章又細劃分為10個小關卡而每個小的關卡都是擁有一名負責守關的boss的，只有成功的擊殺掉守關boss則會自動的過渡到下一關。在每一個關卡里面想要擊殺掉boss的話就必須先擊殺掉3波的小怪，繼而才能夠說見到boss并且挑戰，而每次的挑戰完成都是豐厚的獎勵的例如大量的珍稀仙晶等資源。遭遇首領，除開每一關的boss除外其實在關卡中還內置了一種隱藏的首領，找到并且擊殺掉遭遇首領的話會掉落不俗的資源，以及一定量的機緣寶箱。當然遭遇首領每次擊殺完是需要時間刷新的，不過也可以選擇花費一點仙晶進行直接挑戰。而在副本大廳，會根據角色的等級以及副本進入的限制羅列出各種的副本信息，并且顯示挑戰次數。副本也一般分為四大類經驗本、裝備本、材料本以及寶石本，每個副本的類型都不同想要對應的道具前往指定的副本既可以刷取。當然每日的次數是有限制的，vip等級越高次數越多。最后boss，boss也劃分為個人、仙盟、世界三個類型，獎勵都各不一樣，其中世界boss是所有玩家一起參與的需要搶dps，大家可以根據自己情況選擇挑戰。